Судьба порой играет в слишком жестокие игры, где главные пешки ни в чем не повинные люди. Два друга, два мальчика, не принятые суровым и жестоким миром обычных людей. Чарльз и  Эрик, теперь же больше известные как профессор Ксавьер и Магнето, через многое прошли вместе, чтобы в итоге встать по разные стороны одной войны – войны против людей. Кажется, что дружба, что долгие годы помогала им выжить и не сойти с ума, исчезла из их сердец. Теперь один мечтает уничтожить все человечество, подарив миру одну расу – мутантов, другой же стремится научить людей и мутантов жить в мире и согласии. Идет незримая война за мир. Но все ли так страшно, как кажется на первый  взгляд?
Институт Ксавьера для высшего образования место для одаренных людей. Сюда невозможно попасть благодаря только толстенным кошелькам родителей или благодаря уникальным знаниям. Главный и решающий критерий будет ли человек учиться в институте – наличие уже успевшего нашуметь на весь мир пресловутого Х-гена в коде ДНК. Институт Ксавьера это настоящий дом для ребят, которых отвергло общество, но, при этом, сохранивших веру в людей. Здесь помогают развивать способности каждого, помогают встать на ноги и учат взаимодействию с жестоким миром людей. В остальном же, институт ничем не отличается от подобных ему учреждений. Здесь, как и везде, кипят свои страсти, бушуют ураганы эмоций и, самое главное, студенты не чувствуют себя ущемленными. Здесь они чувствуют себя как дома.
Однако, как же просто нарушить хрупкий мир спокойствия и чувства защищенности. Казалось бы, еще вчера друзья мило шептались о предметах и преподавателях в кафетерии, а уже сегодня половину из них похитили. Кто оказался похитителем группы студентов, и почему именно их, неизвестно. Поговаривают, что это дело рук Магнето, который уже давно мечтает разобрать университет по кирпичикам. Однако, профессор Ксавьер хранит пугающее молчание. Чего же теперь ожидать студентам? Преподаватели заверяют, что бояться нечего, и что все в безопасности, но где гарантия, что похищения не повторятся?